Le sedi delle Università Pegaso, Mercatorum e San Raffaele sono dislocate in alcuni dei più prestigiosi palazzi e complessi monumentali delle città in cui è presente; luoghi di altissimo profilo storico e culturale, testimonianza dell'autorevolezza dell'Ateneo e della considerazione di cui gode presso le Istituzioni che ne hanno riconosciuto l'impegno, la qualità e l'alto profilo didattico e quindi concessone l'utilizzo. Una scelta tuttavia, quella di essere presenti in sedi di riconosciuto prestigio, che non si è voluta per mere motivazioni d'immagine, bensì perchè considerate le più appropriate per garantire allo studente, durante tutto l'excursus accademico, il massimo grado di accoglienza, supporto e decoro. L'attenzione alla logistica quindi, al posizionamento, alla capillarità dei collegamenti ed alla ricettività dei locali sono stati i veri elementi determinanti nella scelta operata dall'Ateneo perchè tutto, in Pegaso, Mercatorum e San Raffaele, ruota intorno allo studente.